Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM10L1P0DMW3 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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