Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN5O00501 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN5O00501 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN5O00501 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN5O00501 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLDN5O00501 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN5O00501 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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