Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP19-206ENST00000548629 1813 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PANK2-206ENST00000497424 4815 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASTN1-203ENST00000367657 4187 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAG1-205ENST00000547306 1531 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF21B-202ENST00000396103 3540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFAP4-201ENST00000299610 1873 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFAP4-203ENST00000497081 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNS2-204ENST00000546602 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNH7-201ENST00000328032 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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