Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNTNAP2Q9UHC6 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms