Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HDAC6Q9UBN7 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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