Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB14-205ENST00000442697 6075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF142-201ENST00000411696 5926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNH1-201ENST00000271751 8172 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMB1-204ENST00000393561 5766 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353593.1-201ENST00000602517 3955 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 COL9A1-202ENST00000357250 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PEG3-202ENST00000593695 4741 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CYFIP1-207ENST00000617556 5674 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC42BPA-202ENST00000366764 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 EPHA5-201ENST00000273854 8266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms