Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SIN3AQ96ST3 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3AQ96ST3 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms