Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SCG3Q8WXD2 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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