Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms