Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms