Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
P3H3Q8IVL6 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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