Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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ATG4DQ86TL0 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ATG4DQ86TL0 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ATG4DQ86TL0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ATG4DQ86TL0 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ATG4DQ86TL0 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ATG4DQ86TL0 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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