Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 PDZRN3-205ENST00000466780 2737 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SKOR2Q2VWA4 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms