Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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RTL8BQ17RB0 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RTL8BQ17RB0 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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