Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GAPVD1Q14C86 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms