Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TCOF1Q13428 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TCOF1Q13428 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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