Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 CMTM1-206ENST00000457188 765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AC068620.1-201ENST00000470544 798 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 CMTM1-215ENST00000531885 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AC134312.5-202ENST00000562705 756 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 OR2A5-201ENST00000408906 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AC074366.1-204ENST00000446277 552 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 162 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AC012186.3-201ENST00000623850 485 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AL390726.1-201ENST00000451357 202 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 RN7SL559P-201ENST00000476501 297 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 AC020663.2-201ENST00000592465 720 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CACNA1BQ00975 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms