Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USP46P62068 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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USP46P62068 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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USP46P62068 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USP46P62068 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USP46P62068 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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