Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBASH3AP57075 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms