Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK7P50613 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK7P50613 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK7P50613 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK7P50613 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK7P50613 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK7P50613 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK7P50613 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms