Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF4P48230 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF4P48230 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms