Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms