Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MLH1P40692 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MLH1P40692 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MLH1P40692 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms