Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP1P29466 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP1P29466 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP1P29466 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP1P29466 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP1P29466 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP1P29466 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP1P29466 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASP1P29466 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CASP1P29466 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CASP1P29466 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP1P29466 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms