Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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