Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 NUP43-203ENST00000367404 1089 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC051619.5-203ENST00000561404 529 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC124319.1-201ENST00000576808 653 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 LINC00969-278ENST00000626870 851 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HOXB1P14653 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms