Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms