Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ITGA4-203ENST00000397033 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 WDR41-201ENST00000296679 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 UTP14A-201ENST00000394422 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 KLC2-202ENST00000394065 3755 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ABRA-201ENST00000311955 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 FBLN5-201ENST00000267620 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ARSK-201ENST00000380009 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AP000894.1-201ENST00000584430 520 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AC012313.5-201ENST00000594816 2517 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 UBIAD1-202ENST00000376810 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 FOSB-206ENST00000586615 3774 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AC020928.1-201ENST00000590750 1850 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PROS1-202ENST00000394236 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 COLQ-201ENST00000383781 2784 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 MTMR2-202ENST00000352297 3350 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CLINT1-210ENST00000530742 3344 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 MINDY1-203ENST00000361936 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 LY9-205ENST00000392203 2213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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COLCA2A8K830 DMBX1-202ENST00000371956 2882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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COLCA2A8K830 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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COLCA2A8K830 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CANT1-202ENST00000392446 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 TAS1R2-201ENST00000375371 2542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
COLCA2A8K830 PDE9A-207ENST00000398224 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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