Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CHPF2Q9P2E5 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms