Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms