Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 LMX1A-203ENST00000367893 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC022382.1-201ENST00000602768 336 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 GLIPR2-201ENST00000377959 812 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ENO3-201ENST00000323997 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms