Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC112Q8NEF3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms