Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VPS8Q8N3P4 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VPS8Q8N3P4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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