Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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CLIP4Q8N3C7 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CLIP4Q8N3C7 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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