Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM71Q2Q1W2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms