Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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CCDC96Q2M329 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC96Q2M329 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC96Q2M329 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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