Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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RRN3P1Q2M238 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RRN3P1Q2M238 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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