Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPRJQ12913 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.7 ms