Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZBED6P86452 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms