Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms