Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MCAMP43121 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCAMP43121 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms