Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGAEP38570 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms