Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP4AP20648 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms