Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BRAFP15056 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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