Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRT13P13646 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRT13P13646 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT13P13646 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms