Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
DKK2Q9UBU2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
DKK2Q9UBU2 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms