Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TFIP11Q9UBB9 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TFIP11Q9UBB9 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms