Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GABARAPL3Q9BY60 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms