Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 302.9 ms