Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERCC4Q92889 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms